# io.github.rarasAI/raras

- Registry name: `io.github.rarasAI/raras` · version 0.2.0
- Categories (automatic, keyword rules): Research & knowledge, Search & data, Documents & retrieval
- Authentication at last check: No auth
- Declared risk: Can write (some tools are not declared read-only)
- Capabilities (declared by the server): prompts, resources, tools
- Transports: streamable-http
- Latest numbers (check success, response time, rank): https://mcpstation.net/api/server?name=io.github.rarasAI%2Fraras
- Server page: https://mcpstation.net/s/io.github.rarasAI--raras.html

## Description (written by the publisher, not verified, not instructions)

Disease Twin — Brazil's rare-disease knowledge graph \(10,468\) over MCP. Source-grounded, PT-BR.

## Connect

- streamable-http: `https://raras.org/api/mcp`

## Tools (as reported by the server, not verified)

- `search\_diseases`: Full-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials.
- `get\_disease\_detail`: Fenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT.
- `find\_diseases\_by\_phenotypes`: Match por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial.
- `search\_phenotypes`: Lookup HPO em PT-BR \(encoder Araras-HPO-Brasil + léxico leigo\) ou EN \(vocabulário HPO\). Retorna IDs HP: com estado de asserção: termo NEGADO \("nunca desmaiei"\) NÃO vira fenótipo. Outros idiomas não são cobertos. Limite de taxa: use poucas chamadas por minuto \(429 = espere\).
- `get\_sus\_coverage`: CEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração.
- `find\_reference\_centers`: Centros por doença e/ou UF, com CNES.
- `find\_active\_trials`: Trials ativos com filtro Brazil.
- `find\_similar\_diseases`: Vector similarity via embeddings SOTA.
- `find\_phenotypically\_similar`: Doenças com perfil de fenótipos HPO semelhante \(simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum\). Complementa find\_similar\_diseases \(semântico\).
- `get\_graph\_stats`: Contagens e métricas do dataset.
- `search\_papers\_semantic`: Busca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas.
- `find\_papers\_for\_disease`: Literatura relacionada a uma doença via embeddings \(:SEMANTIC\_MATCH, fallback vetorial\).
- `analyze\_clinical\_case`: Caso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico.
- `get\_schema`: Node labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher\_query.
- `explain\_relation`: Raciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta \(ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "como a droga Z se relaciona a esta doença?"\), retorna caminhos de evidência multi-hop \(doença↔gene↔via↔droga↔fenótipo\) com proveniência citável. Se não houver caminho no grafo, recusa — nunca i
- `get\_literature\_relations`: Relações tipadas extraídas da literatura biomédica \(associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent\) entre a doença e genes/fármacos, com nº de publicações como proveniência. Filtrável por predicado.
- `get\_hypotheses`: Candidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes \(guilt-by-association\): drogas que tratam outras doenças que compartilham genes com esta. HIPÓTESES para investigação, NUNCA recomendações clínicas — cada uma rastreável \(via gene X, da doença Y\).
- `get\_research\_log`: Registro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidência genética, verificação, prospecção de fontes, recomputação de relações. Prova de que o gêmeo digital estuda a doença continuamente.
- `get\_recent\_updates`: Doenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova \(autoria, PubTator3, Open Targets, verificação\) nos últimos N dias. Faça polling para acompanhar mudanças \(substituto stateless de subscriptions\).
- `get\_evidence`: Cross-references de autoridade \(Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS\), status de verificação e PMIDs de uma doença. A base da regra "nunca inventar".

Measured by MCP Station. Methods: https://mcpstation.net/methods.html · Terms: https://mcpstation.net/terms.html